佛光山旗山禪淨中心位於旗山鎮中正路，臨近中山公園、旗山國民小學，交通便利。此棟建築共有六個樓層（含地下室），外壁粉紅色，配上傳統彩繪，各層樓相間琉璃瓦，融和傳統與現代，為一棟簡單素雅的寺院風格。

一九六七年佛光山開山之初，旗山信眾前往朝禮求法者，絡繹於途；一九八一年租借場地，成立「旗山布教所」，並派法師弘法布教。因共修場地係屬租借，難臻理想，又經四次遷徙，為求正法久住，遂有擇地建寺之議。

一九九五年，經信眾佈施、資源回收，購得現址；翌年七月二十五日動土興建，一九九九年九月竣工，名為「佛光山旗山禪淨中心」，佔地二六○坪，建坪每層一九九坪。

在僧信二眾努力下，結合地方資源，推廣社教弘法活動，成為旗山大眾精神寄託與心靈加油站。未來，將致力人間佛教的弘揚與教化之推展，發揚佛光宗風為大任。